落花落果严重，与营养供应不足也是密不可分的。连阴天时菜农可以通过叶面补肥的方法，增强辣椒的长势。叶面喷施叶面肥，如含硼含锌的叶面肥及核苷酸1000倍混甲壳素1000倍的方法，为辣椒补充能量，提高植株抗性，从而减少因营养消耗过多导致落花落果量。

辣椒发生落花落果时，应及时喷用萘乙酸等植物生长调节剂保花保果，但使用量不能过大，应将使用量控制在30-40毫克/千克之间。使用萘乙酸后，辣椒植株叶片会出现2-3天的曲叶现象，几天之后会自行恢复。