大蒜的病害主要有灰霉病、叶枯病、紫斑病等；虫害有蒜蛆、蓟马等。

病害：精选良种，严格做好种子处理，清洁田园，有机肥一定要腐熟后使用，培育壮苗，适当稀植，通风透光，减少病虫害发生。对于发生的大蒜叶枯病、灰霉病等，可用50％扑海因可湿性粉剂1500倍液，64％杀毒矾可湿性粉剂500倍液、58％甲霜灵锰锌可湿性粉剂500倍液。

虫害：蒜蛆可用50%辛硫磷乳油100毫升-150毫升加水25升-30升稀释，拌种200公斤左右，随拌随播。蓟马可用10%吡虫啉1500-2000倍液，或2.5%多杀菌素悬浮剂1000-1500倍液喷雾防治。